1、形态区别：聚氨酯防水涂料，有单组分与双组分，比较黏稠，黑色或棕色，单组分也有其他颜色。JS由一种粉料与一种乳液配合而成，比较稀，一般为白色，也有灰色，由粉料中的水泥色决定。

2、固化成膜方式区别：不管是单组分还是双组分，都属于反应固化型材料，属于化学反应。JS属水性材料，属挥发固化型，属于物理反应。大部分聚氨酯有一定的溶剂，也有无环保无溶剂型的，由于JS属水性，无溶剂，属环保材料。

3、成膜后的材料性能：强度：聚氨酯1.9~2.45，JS：1.2~1.8；

延伸率：聚氨酯450~550，JS：30~200；低温柔性：聚氨酯－35°~－40°，JS：－10°。聚氨酯的耐水性能比JS好，总体聚氨酯性能要比JS好，造价也更高。

4、施工工艺：目前在云南市场上聚氨酯防水涂料采用滚涂法施工，不铺贴胎体增强材料；而JS涂料大多铺贴1-2层台历增强材料。